Genome Medicine：将蛋白质组学纳入罕见病常规诊断实践的理由

基因组学技术的进步和成本的降低使得更多罕见病患者能够得到明确的遗传诊断。然而，对于那些临床特征高度提示遗传条件但未发现相应遗传原因的患者来说，他们往往被排除在许多有希望的个性化治疗之外。即使有了全面的诊断工具如基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学，这些技术大多仍局限于研究环境内，限制了它们对广大罕见病患者及其家庭的帮助。

在当前的医疗环境中，尽管针对越来越多的罕见病疗法正在变得可及或即将实现，但仍有大量患者因缺乏具体的遗传诊断而无法获得个性化的治疗方案。为此，国外学者提出应将蛋白质组学整合到罕见病的诊断流程中，以缩短诊断时间并扩大治疗选择。

目前在美国，尽管基因组测序等检测手段变得更加普及，但仍存在一些障碍，如费用问题、结果解读困难等。此外，有时即使进行了全面的基因分析，也可能只能找到意义不明的变异(VUS)或者根本找不到任何遗传变异，这导致很多患者的诊断旅程就此停滞。

为了克服这些问题，建议将蛋白质组学纳入常规诊断实践中。一项由Hock等人进行的研究表明，在具有线粒体疾病的个体中，非靶向蛋白质组学分析支持83%的病例中的遗传病因，并且其表现优于传统的线粒体呼吸链酶分析。更具体地说，蛋白质组学不仅帮助确诊了几位临床上高度怀疑患有线粒体疾病但尚未得到明确遗传诊断的孩子，还为一名五周龄即去世的重症婴儿提供了快速的遗传诊断确认，展示了蛋白质组学在加速诊断过程方面的潜力。

尽管前景乐观，但实施这一策略也面临挑战。首先，需要考虑与生成蛋白质组学数据相关的技术和经济成本；其次，如何解释复杂的结果是一个难题，因为并非所有医生都有能力将其与患者的病史和治疗计划相关联；最后，还需仔细权衡使用何种组织进行蛋白质组学分析最为合适的问题，考虑到不同组织间蛋白质表达的差异性，以及侵入性检查可能带来的患者顾虑。

将蛋白质组学等先进工具引入标准诊断实践中，旨在缩短诊断时间，扩展罕见病患者的治疗选项。同时，也强调了教育医务人员关于这些新技术的重要性，以及建立相应的指南和支持系统来协助结果解读的必要性。通过这样的努力，可以更好地服务于罕见病患者群体，改善他们的生活质量。

参考文献：

McCormick, E.M. The case for including proteomics in routine diagnostic practice for rare disease. Genome Med 17, 61 (2025).