张会来/周世勇团队通过单细胞和大量转录组学综合分析发现调节性T细胞特征是DLBCL预后的预测因子
2025-03-09 聊聊血液 聊聊血液 发表于陕西省
天津医科大学肿瘤医院张会来/周世勇教授团队通过整合单细胞和大量转录组数据,建立了Treg相关基因标志物,可预测接受标准免疫化疗的DLBCL患者的预后。
调节性T细胞
弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是一种生物学和临床表现高度异质性的B细胞淋巴瘤,约60%-70%的患者可通过免疫化疗治愈,但仍有30%-40%的患者会复发或对治疗产生耐药。调节性T细胞(Tregs)是一类具有免疫抑制功能的CD4+ T细胞,通常抑制抗肿瘤免疫反应。转录组学和基因图谱的进展大大提高了我们对疾病内在发病机制的理解,揭示了许多潜在的治疗靶点,但肿瘤浸润性Tregs在DLBCL预后中的作用尚存在争议。
此外,尽管CAR-T细胞疗法为血液系统恶性肿瘤的治疗带来了革命性变化,但只有大约半数患者能获得长期缓解,因此需要新的生物标志物来预测治疗反应。
天津医科大学肿瘤医院张会来/周世勇教授团队通过整合单细胞和大量转录组数据,建立了Treg相关基因标志物,可预测接受标准免疫化疗的DLBCL患者的预后,近日发表于《Hematological Oncology》。
研究方法&结果
数据整合:作者整合了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量转录组数据,以识别与Tregs相关的基因特征。
基因特征筛选:通过分析两个独立数据集中的Tregs标记基因,筛选出227个候选基因,并通过GO和KEGG富集分析揭示这些基因的功能和通路,这些基因主要富集在T细胞激活、增殖、分化和适应性免疫反应相关通路中。
risk signature构建:利用单变量Cox回归分析、LASSO分析和多变量Cox回归分析,最终构建了一个包含6个Tregs特征基因的risk signature。
Exp 代表基因表达水平,coef代表通过多变量 Cox 回归计算的基因系数。
risk signature的开发:构建的risk signature基于中位风险评分将DLBCL患者分为低危和高危组,高危组患者的生存结局显著较差。此外,该risk signature的性能优于IPI和细胞起源分类(COO)。
risk signature的验证:通过多个独立队列(包括两个外部队列和一个内部队列)验证,具有高危评分的DLBCL患者的生存结局明显低于具有低危评分的患者,证实了risk signature在不同人群中的广泛适用性。
不同亚组的基因组变异:高危组PIM1、MYD88、DTX1、CARD11、CD79B、ETV6、BCL6和CDKN2A等基因突变更为常见,而低危组TNFRSF14和DNMT3A突变更为频繁。高危患者的突变导致Hippo、NOTCH、MYC、细胞周期和TP53通路失调,而与PI3K和RTK - RAS通路失调相关改变在低危组中富集。根据LymphGen基因分类,高危组MCD亚型(预后差)患病率较高,而低危组ST2和EZB亚型(预后较好)患病率较高;根据Stuart等开发的分类,高危患者中富集预后不良的MYD88和NOTCH2亚型,而低危患者中富集BCL2和TET2/SGK1亚型。
免疫微环境分析:高危患者的免疫评分较高,而肿瘤纯度无显著差异(上图E)。高危组表现出免疫抑制性微环境,而低危组则在肿瘤微环境中富含非细胞成分(上图F)。低危患者具有良好的LME-GC和LME-ME亚型,而高危患者具有较高的LME-IN亚型患病率,高危组也表现出更多的LME-DP亚型,但差异没有统计学意义(上图G)。
CAR-T治疗反应预测:TNFRSF25和SELL两个基因特征可以有效预测Axicabtagene Ciloleucel(Axi-cel)治疗的长期反应。
总结
Tregs特征gene signature:该研究开发了一个基于6个Tregs特征基因的risk signature,能够预测DLBCL患者的临床结局,并与免疫学特征显著相关。
CAR-T治疗的生物标志物:TNFRSF25和SELL的表达水平可以作为预测Axi-cel治疗反应的潜在生物标志物。
临床应用前景:该风险签名有望为DLBCL的临床决策提供有价值的见解,并为开发新的免疫治疗策略提供依据。
该研究通过整合单细胞和批量转录组学数据,不仅为DLBCL的精准医疗提供了新的工具,还为理解Tregs在肿瘤免疫中的作用提供了新的视角,并可能对优化CAR-T治疗的策略产生重要影响。
参考文献
Cui, Y., Hu, G., Han, X., Li, W., Wang, X., Qian, Z., Li, L., Qiu, L., Zhou, S. and Zhang, H. (2025), Comprehensive Analysis of Single-Cell and Bulk Transcriptomics Identified Regulatory T-Cell Features as Predictors of Prognosis in Diffuse Large B-Cell Lymphoma. Hematological Oncology, 43: e70050. https://doi.org/10.1002/hon.70050
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