JHO:从单细胞层面解析胆管癌的异质性及肝外胆管癌的特异性祖细胞微环境
2025-07-24 吾乃喵大人 MedSci原创 发表于上海
本研究提供了 CCA 的综合单细胞图谱,揭示了 iCCA 和 eCCA 亚型之间的分子异质性,基于转录组的癌症细胞亚型划分对于临床分层和功能精准肿瘤学具有重要意义。
胆管癌(CCA)是一种高度异质性的恶性肿瘤,主要由肝内胆管癌(iCCA)和肝外胆管癌(eCCA)组成,其中 eCCA 又可分为肝门部胆管癌(eCCA-P)和远端胆管癌(eCCA-D)。CCA 在胃肠道肿瘤中相对罕见,相关临床试验往往未能关注特定亚型,且目前对于其临床、遗传和转录组差异虽有一定认识,但因组织获取困难等,对 eCCA 的多组学研究存在挑战。从胚胎学角度,肝内小胆管和肝外胆管(EBTs)起源于不同的来源,这导致其干细胞储备不同。研究者旨在利用单细胞和空间解析转录组方法,解决 iCCA 和 eCCA 在临床试验中存在的差异问题,构建包含各种 CCA 亚型的单细胞图谱,以解码其异质性背后的细胞基础、肿瘤微环境(TME)和治疗反应。 研究设计与方法 研究对 28 份样本(包括 7 份慢性胆管炎性病变样本和 21 份不同解剖部位的 CCA 样本)中的 109,071 个单细胞进行全面单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),并通过外部多组学数据集、组织微阵列队列等多种方式对结果进行验证。使用中国上海生物技术公司的单细胞 3’ v3 试剂盒制备文库并测序,将序列读段映射到人类参考基因
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#胆管癌# #CCA#
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#Nat#很有用
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#CCA#CCA 在胃肠道肿瘤中相对罕见,相关临床试验往往未能关注特定亚型,且目前对于其临床、遗传和转录组差异虽有一定认识,
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